Androidでは、現時点ではCipherMail for AndroidとFairEmail (Android)という2つのアプリを利用してS/MIMEの送受信ができます。これらのアプリの使用方法は以下のウエブページを参照してください。
また、Android版のThunderbirdが開発中（K-9 Mail）で、こちらが利用可能になればAndroidでもS/MIME対応のメールの送受信ができるようになると思われます。こちらは、情報のアップデートがありましたらこちらに書き込みます。詳細についてはこちらを参照してください。