Androidでは、現在S/MIMEに対応しているメールソフトはないものと思われます。現時点ではCipherMail for Androidというアプリを利用してS/MIMEの送受信ができます。このアプリの使用方法は以下のドキュメントを参照してください。
また、Android版のThunderbirdが開発中（K-9 Mail）で、こちらが利用可能になればAndroidでもS/MIME対応のメールの送受信ができるようになると思われます。こちらは、情報のアップデートがありましたらこちらに書き込みます。詳細についてはこちらを参照してください。